A CAFAZ é constituída de uma Diretoria e dois Conselhos eleitos pelos associados.
 
A Diretoria é formada por um Presidente, um Diretor Executivo e um Diretor que, atuando sempre de forma conjunta em suas decisões com os Conselhos de Administração e Fiscal, passa a denominar-se de Colegiado, pressuposto de uma gestão democrática que requer a mais plena participação dos associados da CAFAZ.

Os Conselhos de Administração e Fiscal são formados por três membros efetivos e três suplentes, cada um.

O Estatuto da CAFAZ é o instrumento que define as atribuições da Diretoria, Conselhos de Administração, Fiscal e Assembleia Geral.